成立于2005年，是专业从事农产品加工研究的省级研究机构。全所在职员工82人，具有高级技术职称人员46人，入选国家级人才工程1人。现有国家现代农业产业技术体系专家1人、享受国务院特殊津贴专家1人、江苏省有突出贡献中青年专家1人、江苏省现代农业产业技术体系专家5人、江苏省“333高层次人才培养工程”培养对象7人。

研究所聚焦农产品保鲜加工、营养健康、智能制造三大学科领域，开展应用基础研究、关键技术与装备研发、新产品创制和集成示范及转化应用。建有国家蔬菜加工技术研发专业分中心、农业农村部农产品冷链物流技术重点实验室、农业农村部水生蔬菜产地加工技术集成基地、农业农村部水产品保鲜贮藏加工技术集成科研基地、江苏省特色农产品营养与功能化开发工程研究中心、江苏特色农产品绿色加工技术产业孵化基地等7个部省级科研平台、以及江苏省研究生工作站等人才培养平台。

研究所累计承担科研项目795项。荣获江苏省科技一等奖、江苏省科技二等奖、中华农业科技二等奖等各类奖项94项；完成21项科技成果第三方评价；拥有国内外授权专利274件；制定各类技术标准130项，其中行业标准3项；发表学术论文1240篇，其中SCI收录332篇。

研究所以“科技创新支撑产业高质量发展”为根本任务，立足自主创新和成果转化，加快人才培育，扩大交流合作，为助推三产融合和乡村振兴不懈努力。